JKT48は、48グループ初の海外支店として、2011年にインドネシアの首都ジャカルタに誕生しました。
現地採用の1期生としては、インドネシアと日本のハーフで大阪出身のアヤナ・シャハブ（日本名：シャハブ彩菜）と、日本人で東京出身の野澤玲奈（当時の表記はレナ・ノザワ、後にAKB48に移籍）が加入。
結成2年目の2012年には、AKB48から仲川遥香と高城亜樹が移籍し、さらに2014年には同じくAKB48から近野莉菜が移籍。特に仲川遥香はJKT48の中心メンバーとして活躍しました。
2018年には6期生としてハーフのエリカ・エビサワ・クスワン（日本名：海老沢恵莉香）が加入。ここまでに挙げた6人は2019年までに全員グループを卒業しており、2020年2月現在のJKT48には日本人や日本ハーフのメンバーは在籍していません。